大家好，今天我分享的文章是最新发表在Developmental Cell上的“A Proximity Labeling Strategy Provides Insights into the Composition and Dynamics of Lipid Droplet Proteomes”。本文通讯作者是UC Berkeley的助理教授James A.Olzmann，其实验室主要从事脂滴形成和ERAD的研究。
脂滴是几乎所有细胞里都存在的储存脂质的细胞器，成熟的脂滴有一单层磷脂膜包裹，膜上有很多蛋白参与到脂滴的功能执行中。鉴定脂滴中蛋白质组的组成一直具有挑战，因为传统的体外分离方法会产生很多污染蛋白。而近几年来基于APEX技术分析各种细胞器蛋白组成的工作层出不穷，作者也想利用此方法的优势鉴定脂滴中的蛋白组成，从而为脂滴功能的研究提供线索。
在这篇文章中，作者将APEX2重组表达在两个已知的脂滴定位蛋白上，从而在活细胞水平实现了脂滴相关蛋白的生物素化标记。结合SILAC技术，作者在两个细胞系里鉴定到了大量的已报道验证过的脂滴相关蛋白，同时没有常见的污染蛋白，表明此方法的可行性。同时，作者也鉴定到了一些新的脂滴相关蛋白。
作者进一步想探究这些脂滴蛋白的降解过程，因为脂滴的形成与内质网密不可分，所以作者想探究脂滴蛋白跟内质网降解系统的关系。在加入其抑制剂后，作者通过定量蛋白质组学观察到一个脂滴蛋白c18orf32的显著升高。作者进一步通过生化实验证明c18orf32的降解由内质网降解系统所介导。总之，作者将APEX技术应用于鉴定脂滴中的组成蛋白，并基于此发现了一个脂滴蛋白的降解途径。
原文链接：
http://www.cell.com/developmental-cell/fulltext/S1534-5807(17)30981-4
原文引用：
DOI: http://dx.doi.org/10.1016/j.devcel.2017.11.020
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