(文章篇)S3E6:一篇蛋白-RNA-RNA互作研究的文章

2023-05-10 14:56:27

在昨天的文章中,我们介绍了lncRNA调控蛋白表达的第二种方式:调控蛋白的翻译过程,即通过促进蛋白翻译来提高蛋白表达,或者抑制蛋白翻译来降低蛋白表达,那么今天我们来分享一篇文章来说明lncRNA 参与的翻译过程在蛋白水平调控中的作用。

Yoon JHAbdelmohsen KSrikantan SYang XMartindale JLDe SHuarte MZhan MBecker KGGorospe MLincRNA-p21 suppresses target mRNA translation.Mol Cell. 2012 Aug 24;47(4):648-55. 

这篇文章还是关于lincRNA-P21的,时间是12年8月份,影响因子:14分。


讲之前建议大家看看前面(文章篇)S3E5:一文掌握LncRNA—蛋白—DNA互作研究方法,因为这篇文章里面不仅有RNA和蛋白互作常用的RIP和RNA Pull down,又出现了RNA与RNA结合的实验,有些烧脑。

好的,按照惯例,先上机制图


刚看有点懵,实际上讲了这么个故事:

lincRNA-P21通过结合Rck(一种抑制mRNA翻译的蛋白),抑制CTNNB1, JUNB mRNA的翻译过程,结果下调β-catenin 和 JunB表达水平;而HuR可以通过招募let-7/Ago2 降解lincRNA-P21,下调lincRNA-P21的水平。其实就是一个HuR下调lincRNA-P21,lincRNA-P21下调β-catenin 和 JunB的思路,这样就把lincRNA-P21的上下游嵌套组合在了一起。

打个比方,小P(lincRNA-P21)是个熊孩子,在家长老H(HuR)不在家的情况下,纠集了小R(Rck)堵在小C(CTNNB1)和小J(JUNB)回家的路上,不让他们回家(翻译成β-catenin 和 JunB);不过一旦家长老H(HuR)在家,在家庭作业(let-7/Ago2)的压力下,小P(lincRNA-P21)就只能老老实实的了。

这篇文章的内容主要就是两部分,分别对应有无HuR的情形:

  1. HuR通过招募let-7/Ago2 ,降解lincRNA-P21,下调lincRNA-P21表达;

  2.  lincRNA-P21与翻译抑制蛋白Rck、CTNNB1, JUNB mRNA结合,抑制CTNNB1, JUNB翻译。

第一部分讲的是在HuR存在的情况下,HuR介导的lincRNA-P21降解,实验内容包括三点:

  •  lincRNA-P21与HuR结合;

  •  lincRNA-P21与Ago2 结合;

  • HuR与let-7/Ago2协同降解lincRNA-P21;


第二部分讲的是在HuR不存在的情况下,lincRNA-P21介导的CTNNB1和JUNB翻译抑制,实验内容包括两点:


  •  lincRNA-P21与CTNNB1, JUNB mRNA直接结合,并下调β-catenin 和 JunB表达,排除对CTNNB1和JUNB mRNA和β-catenin 和 JunB降解的影响;


  •  lincRNA-P21与Rck结合,抑制CTNNB1, JUNB翻译。


这篇文章的大概内容就是这样,有几点需要需要说明:

1. 这篇文章从lincRNA-P21的角度出发,其上下游的机制都有涉及:上游是HuR与let-7/Ago2对lincRNA-P21的降解,下游是lincRNA-P21借助Rck对CTNNB1, JUNB翻译的抑制。

2. 这里除了蛋白与RNA之间的相互作用外,出现了RNA与RNA的相互作用,实际上原理很简单:类似于RNA Pulldown,不过检测的是RNA而已;

3. 作者在确定lincRNA-P21对β-catenin 和 JunB表达调控时,合理排除了CTNNB1和JUNB mRNA和β-catenin 和 JunB降解的影响,即:首先确定lincRNA-P21对β-catenin 和 JunB表达调控发生在蛋白水平上,又排除了蛋白降解这一出口,最后再证明蛋白翻译这一入口,非常严谨。


好了,今天的文献分享就到这里了,全文下载链接:http://pan.baidu.com/s/1eRUulKu。



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