手把手教你细胞RNA提取的方法

2023-05-10 14:56:27

    前面我们一块学习了蛋白质的数据库蛋白的提取过程,那么研究基因的表达和调控时常常要从组织和细胞中分离和纯化RNA。目前常用Trizol法进行提取组织或细胞中的RNA。

    Trizol法是一种新型总RNA抽提试剂,内含异硫氰酸胍等物质,能迅速破碎细胞,抑制细胞释放出的核酸酶。

    虽然Trizol里面含有RNA酶抑制剂的,1ml的Trizol一般最多只能裂解100mg的组织。但是如果组织过量,Trizol无法完全浸润组织无法完全裂解组织,多余组织内的RNA酶等物质会导致RNA的降解。这是RNA降解的很重要的原因。                                             

    同时,由于RNA容易降解,在实验过程中一般都要求口罩的,避免组织的污染。同时选用的无RNA酶的进口枪头、EP管以及DEPC水,在提取过程中,一定要时刻提醒自已RNase Free-RNase Free-RNase Free,实验就成功一半啦~


实验提取步骤

标准Trizol提取步骤为 液氮研磨--加入Trizol裂解--加入氯仿抽提--离心--加入氯丙醇沉淀--离心--酒精洗涤--离心。


1
将细胞培养皿置于冰上,加入Trizol裂解5-10分钟,用枪头轻轻吹打后吸取液体放入进口EP管中。

2
加入1/5体积的氯仿,上下混匀液体,4度静置10-15分钟。(氯仿为有机溶剂,有效的使有机相和无机相迅速分离。有机相中主要是酚和蛋白结合,从而使得蛋白和RNA脱离,RNA进入水相)。

3
4度离心15分钟,一定注意选择低温离心。离心后分成三层,RNA在上清里,从离心机轻轻拿出EP管,以免管内物质震荡导致下层沉淀激起。吸取上清的时候一定要动作轻柔,切忌吸取太多,一般吸到400-500ul,避免吸到下层沉淀,将液体置于新的EP管中。

4
加入等体积异丙醇,4度静置10min,然后12000rpm离心10min。异丙醇主要用于沉淀RNA。

5
取出EP管后可以见到侧壁沉淀,轻轻吸弃上清。

6
向EP管中加入75%酒精洗涤沉淀,帮助分离剩余的有机试剂(剩余有机试剂过多会影响OD值和PCR反应),轻弹沉淀,使其浮在酒精,静置1-2min,让酒精充分接触沉淀,充分溶解有机试剂,然后4度离心5min。轻轻吸弃上清。

7
将EP管再次放于离心机中瞬时离心,弃掉管壁残余液体。然后将EP管置于超净台中干燥5-10min.。注意RNA样品不要过于干燥,否则很难溶解。

8
加入50ul  DEPC处理水,震荡充分溶解沉淀。

8
测量RNA浓度。将RNA保存于-80度。



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