【网络讲座】蛋白质谱鉴定行业标准软件Mascot 2.6新功能介绍,即将开讲!

2023-05-18 23:00:13

开篇小编先来聊聊本次网络讲座的主角-Mascot


Mascot是针对质谱数据，利用蛋白质序列数据库、谱图数据库比对检索的方法来鉴定样本中蛋白质定性、定量以及翻译后修饰的行业标准软件。Mascot Server是质谱数据处理的核心软件，架设在基于HTTP的网络服务中，可以支持从本地或网上提交任意数量的谱图进行搜库鉴定和定量。


Mascot可以支持并能够嵌入目前绝大多数的质谱系统进行质谱数据的分析解读，包括AB Sciex、Agilent、Bruker、Jeol、Shimadzu、Thermo Scientific、Waters等蛋白质谱仪。同时Mascot提供了一个自动化、标准化的数据库上传管理、数据结果解读、导出方案。帮助您不但可以构建面向各质谱仪的数据分析平台，而且可以向整个学校的用户提供在线的分析结果查看和报告输出服务。


以下是Mascot 2.6新功能介绍详细内容，机会只有一次，不要错过!


时间：2017/7/14(周五) 下午3 : 00-4：30

主办单位：上海康昱盛信息科技有限公司

主讲者： 李文婷 | 生物信息学部 | 技术工程师


内容简介

Mascot是Matrix Science公司开发的蛋白组学质谱数据分析专业软件，是目前最主流的蛋白质谱分析搜索引擎，是蛋白质组学质谱鉴定的行业标准软件。

 2016年12月，Mascot server正式发布了2.6新版本。另外，在刚刚结束的美国质谱年会（ASMS）上，Mascot Server继续发布了2.6.1版本的技术更新。

本次网络课堂围绕Mascot Server2.6的新功能进行详细介绍，主要包括以下内容：

1Search engine

• 去除了原有在采用多数据库联合搜库时，对数据库必须是同一类型的限制

• 该版本最大的更新是可以综合利用NIST MSPepSearch进行谱图库搜索


2报告中一些算法的修改

• Percolator提升到3.0版本，将 Percolator 的计算扩展到所有等级

• 扩展了FDR的计算，不仅基于PSM计算FDR，同时可以对Peptide Sequence 数目进行FDR计算

• 报告13C的校正后的质量增差


3Mascot Daemon的更新

• 导出和导入工作任务数据库

• 直接提交搜库任务

• 更好地展示状态信息

• 搜索任务连续运行

• 状态的树状图信息过滤

• 自动导出XML格式定量结果

• 更灵活的数据导入过滤


4Administration

• Perl的“私人化”副本

• Database Manager支持谱图库

• 有计划地删除过去的缓存文件，释放磁盘空间

• 从数据库状态中提供链接用于数据库再压缩

• 在ms-review 中设置默认展示的列


5利用谱图库对蛋白鉴定

• 搜库参数设置

• 结果报告

• 参考数据库

• 打分与统计

• 数据库配置


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