血清/血浆类样本为什么要去高峰度蛋白质呢?

2023-05-18 23:00:13

小G老师

各位同学好!欢迎再一次来到G老师大讲堂(⊙o⊙)…,小美,老师还没讲你怎么就举手了?

小美

小G老师,我现在收集了一批临床样本,是血清,想要寻找肝癌早期诊断的标志物。我想从蛋白质组层面去寻找。我在样本制备的过程中有什么需要特别注意的么?


小G老师

哦,原来是这个问题啊!首先,我们来看一张图。这张图是血清/血浆类样品中蛋白质分布的统计图。


小G老师



小G老师

从这张图中,我们可以发现,在血清/血浆类的样本中各类蛋白质的含量差异非常大,从高到低几乎相差了十个数量级。而在质谱系统中对于信号的检测是有倾向性的,往往是相对强度高的信号才更容易被检测到(蛋白质的含量高,一般来说它相关的质谱信号强度也是比较高的),这个就好比我们走在大街上,迎面走来了姚明和潘长江(无意冒犯潘老师哈),我们肯定先看到姚明,就更不用说是姚明脚边上的小蚂蚁了。


小G老师

所以,我们就可以发现两个问题,血浆类样本中有很多蛋白质含量相对比较高,而这些蛋白质会影响到低丰度蛋白质的鉴定。同时呢,很多对人体生理状况具有更灵敏反应度的蛋白质又恰恰是中低含量的,因此,在采用血清或者血浆这些样本进行蛋白质组分析的时候,我们最好先对样本进行去高峰度蛋白质的处理,这样,我们才能够得到更多中低丰度蛋白质的信息。

小美

好有道理,但是怎么去掉呢,我不会做啊!


小G老师

去高峰度蛋白,这可麻烦啦,你可以参考血浆类样本去高峰度蛋白质的方法,这节课~


小G老师

我说,你就把样本送到吉凯基因去吧,听说他们采用安捷伦的Multiple Affinity Removal LC Column – Human 14 来去除人血清、血浆样本中的14种高丰度蛋白质,体系稳定,效果显著!


小G老师

最重要的是,现在戳下面报名,有机会获得全国限量50个免费名额,抓紧时间吧!


小G老师

好了,今天的G老师大讲堂到此结束,给你留一个课后作业,认真看去高峰度蛋白的视频,下次要考试哦!



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