“梨花似雪草如烟,春在秦淮两岸边” --首届”蛋白质组学金陵论坛”侧记

2018年6月9日，由景杰生物、南京大学、南京医科大学、南京鼓楼医院联合主办的首届“蛋白组学金陵论坛”在古城南京落下帷幕。短短的一天时间里，来自华东地区特邀的约150名参会嘉宾齐聚一堂，交流“蛋白质组学-精准医学”最新研究进展，分享科研心得体会。本报道回顾论坛亮点，采撷报告精华，以飨读者。

    南京医科大学药学院陈芸教授，分享了“运用靶向蛋白质组学方法检测临床生物大分子标志物的策略”的学术报告。疾病标记物的筛选和检测，是蛋白质组学在精准医学领域的一个重要运用。陈芸教授是国内利用靶向蛋白质组学分析开展临床检测的最早的学者之一，是该领域的杰出科学家。其课题组针对临床检测中遇到的表达水平低、多亚型、存在同质异构情况的“疑难蛋白质”，创新性的靶向蛋白质组学监测方法让人眼前一亮。结合质谱方法分析核酸-多肽融合分子，实现了对核酸分子快速准确的分析，为基于质谱分析技术的DNA临床诊断开辟了一条新颖的道路。

西湖大学郭天南教授分享的“蛋白质组大数据和人工智能”，深入探讨了运用PCT-SWATH的方法结合最前沿的人工智能的大数据分析，高通量大样本地获取与疾病相关的蛋白质组信息的策略。郭教授师从著名的Ruedi Aebersold教授，在蛋白质组技术开发与运用上做出多项原创性技术成果。郭教授建立的高通量临床蛋白质组方法学（高压循环-卫星扫描质谱技术，PCT-SWATH），能够消除人工提取蛋白的差异，并大大加快蛋白提取酶解的进程，同时极大地提高了实验的可重复性和数据的可靠性，实现了对微量的临床样本。之后郭教授更是利用机器学习的方法，去除不同个体之间的差异及癌症组织不同部位之间的差异，从而鉴定出与疾病（如肾癌等）发生相关的蛋白质。

景杰精准医学研究中心卜晨博士分享的“蛋白质组技术在生物医学研究中的应用策略”，以景杰生物共同发表的众多实际案例为例，对蛋白质组学在生物医学研究中的科研思路、实验策略、技术路线、数据分析、功能验证等方面做了全面阐释，引起了在场师生的广泛关注。讨论中大家充分认识到蛋白质组学在生物医学的研究中发挥着日益重要的作用，不仅广泛运用于疾病发病机制、药物作用机制、生物学功能的研究，同样也运用在生物蛋白质标志物的发现与检测中。基于蛋白质组学与蛋白质修饰组学的深入研究，势必会推动整个生物医学领域机理研究、疾病免疫、药物开发、临床诊断等各方面的运用进展。

南京大学医学院的方雷教授，为我们分享了“NCUS-iTRAQ技术在极微量临床样本蛋白质疾病标志物筛选中的应用”。众所周知，微量临床样本的蛋白质组学分析是大势所趋，但也是急需解决的技术难点。如何对极微量临床样本进行蛋白质组学的研究，进而进行疾病标志物筛选与临床检测，是临床蛋白质组学研究中兼具重大科学价值与挑战性的课题。方雷教授利用NCUS（Non Contact UltraSonic）非接触式超声波的样品制备技术，能够对仅仅由20个肾小球组成的样本提取蛋白，并通过痕量HPLC对样品进行分级，从而实现了对糖尿病肾病标志物的筛选工作。为了研究肝癌的发病机理，方雷研究组分别分析肝癌组织、肝癌癌旁组织及远癌组织，并对肝癌病人进行长期的跟踪，实现对肝癌手术患者的复发性进行准确预测。

刚刚从Emory大学特聘回国的南京鼓楼医院的柏兵教授为与会者带来了“阿茲海默症分子网络的深度多层级的大脑蛋白组分析”。目前阿兹海默症的真正成因仍旧不明，对阿兹海默症的准确诊断、疾病机制的研究是当前科研界的共同关注点。  

柏教授的报告分为三个部分， 第一部分介绍了如何利用Label Free的质谱检测定量方法分析不溶蛋白的蛋白质组；第二部分探讨了利用C¹³同位素的方法标记，进而定量地鉴定蛋白质的切割位点。第三部分柏教授将蛋白质组学与蛋白质磷酸化修饰组学对阿茲海默症的全蛋白进行联合分析，揭示出阿茲海默症的关键蛋白网络，并对其节点性关键蛋白Netrin进行功能验证。

来自南京医科大学的王富强研究员为大家带来“基于质谱技术的免疫响应超分子水凝胶用于肝脏移植排斥”的精彩报告。器官移植手术中的一个关键性问题就是移植排斥反应，这种反应是一种机体对移植器官的免疫响应，临床上应用免疫抑制剂进行预防，长期使用免疫抑制剂导致严重的副作用。王富强课题组通过蛋白质组学手段发现了p56LCK与移植排斥反应的关系，将其作为启动“点击反应”的关键激酶，并设计了智能的超分子水凝胶递药系统。最终实现精确给药抑制T细胞活化，从而抑制免疫移植排斥反应。同时较低的药物浓度避免副作用的发生，从而提高患者的生存率和生活质量。

景杰精准医学研究中心的潘宗德博士分享了“血液蛋白质标志物的筛选和检测方法”。潘博士以血液蛋白质组学为例，深入探讨了运用蛋白质组学的方法鉴定新的体液生物标志物的方法，引起与会者的热烈讨论。值得一提的是，潘博士还重点介绍了目前科研的前沿——在外泌体中寻找新型的生物标志物的研究方法。通过实际的案例分析，潘博士指出外泌体能够解释疾病的机理、肿瘤转移机制、生物标记物等领域，通过蛋白质组学与蛋白质翻译后修饰的联合分析，能够更加准确地对疾病进行诊断及分型。

在此，我们感谢参会的诸多专家学者带来的精彩报告。越来越多的研究表明，并非所有的基因层面上的改变都对疾病的发生有贡献。传统的基因层面的研究，并不能真正体现“精准医学”中“精准”的概念，原因是影响蛋白质功能的因素不仅仅在基因突变这一个层次，更有蛋白质表达水平及蛋白质翻译后修饰状态的调控。随着精准医学的深入发展，蛋白质组学层面的研究愈加体现了“精准”的内涵，在诸如疾病机理研究、生物标志物发现、临床检测、新药开发等方面的广泛应用，极大的推动着精准医学的发展与进步。

    “精准医学与蛋白质组学”系列研讨会与学术沙龙全国火热筹备中，欢迎扫码关注，获取一手学术资讯。