“蛋白质组学的研究是生命科学进入后基因组时代的特征，不仅是探索生命奥秘的必须工作，也能为人类健康事业带来巨大的利益。蛋白质不仅能为生命活动规律提供物质基础，而且蛋白质丰度的改变能够阐明多种疾病的机理。相信科技君今天为大家介绍的几个蛋白质组的研究技术，会为您的科研带来新的突破。”
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蛋白定量DIA
华大2017年度明星产品，样本不受限，准确性更高
（注：为区别于传统DDA模式的Label free产品，“蛋白定量Label free升级版”产品正式更名为“蛋白定量DIA”）
相关阅读：
—Label free升级版 vs iTRAQ|到底谁才是最强蛋白组定量分析方案
部分测试数据展示
DIA模式蛋白鉴定数提高30%以上
图1 6例膀胱癌（癌症、癌旁组织）DDA vs DIA蛋白鉴定数比较
技术稳定性好，大样本量项目QC样本CV≤25%
图2 样本肽段CV平均分布
17例结肠癌样本（共分为3组，每组包括癌旁组织Normal-N、息肉组织XR和肿瘤组织Tumor-T，混合后的样本标注为QC，作为DIA数据采集的质控）结果显示，QC样本的CV在150针的大项目中（跨度45天），可控在25%以下，具备极好的技术稳定性。
定量精度更准
图3 E.coli掺入实验肽段定量准确性评估
A549细胞分别加入不同比例的E.coli样本（E.coli掺入比例为1:2:5:10，对应样AE1/AE2/AE5/AE10），分别进行DDA与DIA模式采集，结果显示，相对于传统的DDA定量，DIA定量有更好的定量精度（密度分布图峰型更集中）。
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蛋白修饰分析（磷酸化、乙酰化）
蛋白修饰全景图，全面的鉴定，更多的功能分析
推荐理由：蛋白质组学研究只有蛋白定性和定量？No，人类基因组中约4%的基因编码蛋白激酶，1/3表达的蛋白可被磷酸化，多样的蛋白翻译后修饰对细胞周期调控、代谢等生命活动发挥着巨大的作用。基于质谱的蛋白修饰组研究技术，助您全面了解蛋白组修饰全景，准确提供修饰肽段表达量变化信息，深入分析修饰蛋白功能！
基于质谱的蛋白修饰组研究技术，目前针对蛋白磷酸化（P-Ser/Thr/Tyr）、蛋白乙酰化（Ace-Lys）等重要修饰形式，采用液质联用技术，通过华大质谱鉴定流程整合Proteome Discover、percolator和Maxquant软件，对整个蛋白质组的修饰情况进行修饰位点鉴定、表达量统计、功能富集分析。
部分测试数据展示
鉴定效果达到文献中上水平
表1 不同样本类型iTRAQ磷酸化蛋白鉴定结果
磷酸化定量精度准、重复性好
图4 iTRAQ磷酸化定量精度评估
HCT116细胞肽段100ug2份、200ug3份、400ug3份，按照图4（左表）进行标记并富集，Q-Exactive检测，Proteome Discoverer进行磷酸化肽段鉴定以及定量（右图）。
深度挖掘蛋白翻译后修饰的功能
图5 motif分析及激酶分析
激酶分析（上）提供基于磷酸化蛋白本身功能的分析，motif分析（下）提供基于磷酸化位点的功能分析
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蛋白修饰定量验证技术PRM
蛋白修饰定量验证的首选技术！
推荐指数：★★★
推荐理由：蛋白修饰组分析之后，还在准备抗体验证？你out啦！没有准备抗体的漫长等待和实验误差带来的烦恼，PRM技术为您提供成功率极高、重现性好、定量结果更为准确的蛋白修饰定量验证技术！
蛋白修饰组分析之后，得到差异表达的修饰肽段信息，可通过平行反应监测(Parallel reaction monitoring, PRM)技术进行验证。PRM技术是一种基于高分辨度、高精确度质谱的离子监视筛选技术，能够对目标蛋白质、目标肽段进行选择性检测，实现对目标蛋白质和肽段进行精准定量的目的。目前，华大的PRM技术主要应用于蛋白修饰定量的靶向蛋白验证，相比于传统的修饰抗体验证技术，有操作简单、稳定性高、定量结果更准确的特点。
图6 PRM流程
混合肽段首先进入四级杆（Q）进行靶标母离子筛选，筛选出的母离子经过碎裂室产生碎片离子，然后所有碎片离子都在高分辨的orbitrap中进行检测，得到时间连续的完整精确的二级质谱信息用于准确定量。
部分测试数据展示
近乎完美的定量线性和技术重复性
图7 定量线性展示
横坐标展示样品（合成磷酸化肽段-VPQLEIVPNS[+80]AEER from α-casein）浓度（单位是ng/μl）取log10，纵坐标是定量峰面积，α-casein磷酸化肽段定量标准曲线结果显示了很好的定量线性和重复性。
明星产品蛋白定量DIA，全景式的蛋白修饰分析，加上精准的蛋白修饰定量RPM技术，这个酷热的夏天，是否感受到科技君为大家带来的丝丝清凉呢？还在等什么，大家快来体验吧~
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撰稿：段 欣
编辑：市场部
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