在中国环境科学学会2017年科学与技术年会专题分会——“土壤与地下水污染治理技术研讨会”上,多位重量级行业大咖发表了精彩报告。
下面我们一起分享北京师范大学许洁的报告。
应用差异蛋白组学分析多环芳烃降解菌的蛋白功能调控
北京师范大学 许洁
差异蛋白组学是通过比较分析不同状态下或近似物种间蛋白质的表达图谱,实现对体系内代谢调控的动态监测,从而揭示机体对内外界环境变化产生反应的本质规律。
同位素相对和绝对定量技术(iTRAQ)是以高通量分析生物样本中的蛋白及其表达情况,通过比较不同样本之间的差异蛋白,全面系统地揭示生理过程的变化。该技术非常有优越性,准确度大大提高,可以直接进入质谱,获得的差异蛋白数量提高了不止一个或者两个数量级。这个技术目前主要应用于医学、植物学,应用于微生物方面很少。
许洁所在的课题组创新性地将该技术应用于多环芳烃的降解研究,并以案例的形式分享如何应用该技术来研究前期筛选出来的蛋白调控。
最后许洁分享了启发和展望,她发现现在研究机理更多是有到是分子生物学手段,以后的研究方向是提取不同条件下的蛋白,可以对环境因素,对降解的影响,从而实现一种共同调控。
基因组学侧重生物体可能发生什么变化,通过转录为转录组,而蛋白质组学侧重生物体正在发生什么变化,代谢组学则说明生物体已经发生了什么变化,看到这四个组学其实是有相互关联的。
介绍的案例是微生物降解多环芳烃的蛋白质组学研究,实际上,大家研究其他有机污染物,比如内分泌干扰物,或者有人研究的是植物-微生物联合修复石油污染物,在研究蛋白层面的降解机理的时候,都可以借鉴iTRAQ技术。
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北京建工修复(ID:BCEER2007)
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