奔走相告—史上最实用生物信息课程开班啦!

学了课程能干啥？

超级实用的生物信息课程，一课搞明白NGS到底在玩儿啥！

带你直接晋级level 2 （level 2是啥阶段，点开链接看一看），并且还将解答以下问题：

1. 转录组、表观遗传组实验设计

（要有三个replicates吗？要做对照吗？什么样的对照呢？模型这样做合适吗？选取什么样的样品，样品处理会不会有问题，存放及运送条件都是怎样的呢？……）

2. 数据分析结果怎么看，怎么用

（GO，KEGG，GSEA，heatmap，K-M曲线，averageprofile等等这些图都代表了什么意义，我们能拿这些结果干什么？）

3. 我也能学会的R语言

（为什么别人文章里的图都那么好看？简单的统计分析其实一点都不难。）

4. 我要学实用的数据库用法

（UCSC，TCGA，GEO等等都怎么去看，具体有哪些用处呢？）

5. 生物?也能分析别人的数据发paper

（我可以通过公共数据挖掘，不做实验就发表文章吗？应该怎么操作呢？）

哪些人群适用？

1. 上述问题也曾萦绕于脑海的同类。

2. 有生物、医学数据分析需求的临床及基础科研工作者们。

3. 希望通过挖数据库挖出文章的筒子们。

为期3天的超详细课程表！

2017.4.7
上午	1) 二代测序技术简介及实验设计（包括，基因组，转录组，表观遗传组）	9:00-10:20
	1) 利用GEO，DAVID等数据库在线完成表达谱数据深入挖掘。	10:30-12:00
午间休息
下午	1) Linux操作系统和常用命令介绍(操作演示)	13:30-15:30
	1) R语言(软件安装，文件读写) a) R语言特点 b) R的数据结构 c) 循环控制 2) R绘图(barplot, boxplot, heatmap)	15:30-17:00
2017.4.8
上午	DNA测序数据分析流程和应用介绍介绍 a)DNA测序数据特点和分类   b)测序数据质量检测要素 c)癌症基因组测序数据课题设计思路 d)  TCGA数据检索和相关数据库介绍	9:00-10:20
	CRISPR screening实验设计原理和应用 a) 质量检控要素介绍 b) CRISPR数据分析流程介绍	10:30-12:00
午间休息
下午	临床试验课题设计和要点	13:30-15:00
	临床数据特点和分析方法介绍	15:10-17:00
2017.4.9
上午	1)    基于表达谱数据的药物重定位 a)    Connectivity Map数据库使用与结果解读 b)   不同的药物重定位方法简介 c)    实例讲解 d)   基于RNA-Seq数据进行药物重定位	9:00-10:20
	2)    实用生物医学相关数据库简介。 a) 常用生物医学数据库简介 b) 其在具体的药物筛选中的实际应用	10:30-12:00
午间休息
下午	1) 生物信息高级专题和科研心得分享 什么是生物信息的核心问题？ 如何有效利用高通量测序这个技术？	13:30-15:00 15:10-17:00

更详细的课程说明：

1）二代测序技术简介及实验设计。

a.测序目的、方法及分析流程概览

b.测序在医学研究领域中的应用

c.表观遗传组学（ChIP-seq，ATAC-seq）技术分享

2）利用在线数据库完成表达谱数据深入挖掘

a. GEO，DAVID数据库得到显著差异基因及富集通路；

b. TCGA了解关注基因对癌症生存率的影响；

c. cistromeDB，UCSC，Fantom5了解关注基因上游转录因子或增强子情况。

3）DNA测序数据分析教程

a.DNA测序数据特点和分类 

b.QC 

c.剩下的比对+鉴别 

d.突变位点分析和功能鉴别

4) 癌症DNA测序课题设计思路和要点

a.癌症驱动基因鉴别和局限；

b.分析分型和巨响 

c.结合临床数据分析和潜在难点，案例简介 

d.药物靶点鉴定，结合PDX老鼠以及CCLE数据和潜在困难和解决方案。

5) TCGA数据检索，cbioportal和firebrowser数据运用

6）CRISPR数据原理和应用以及课题设计

7）CRISPR数据分析

a.QC要点 

b.分析

8）临床数据设计和分析

a.alpha定义和beta定义，双盲 

b.primary outcome & secondary outcomes 

c.样本量估计 d.以往分析过程中遇到的问题,包括多中心的qc问题，和alpha的选择

9）分析方法，ITT原则等，结合数据特征来运用合适的统计方法，结合简单的案例

10) 临床数据文章的结构 表1 表2表3 和图1 或者图2

11) 基于表达谱数据的药物重定位

12) ConnectivityMap数据库使用与结果解读

13) 不同的药物重定位方法简介

14) 实例讲解

基于RNA-Seq数据进行药物重定位

 15) 实用生物医学相关数据库简介。

a. 常用生物医学数据库简介

b. 其在具体的药物筛选中的实际应用

 

课程费用：3000元/人

培训时间：2016.4.7-4.9

地址：上海市杨浦区赤峰路65号同济科技园1号楼

说明：培训班级人数不超过35人。培训提供午餐、饮用水等。实操训练，请大家备好电脑（可无线上网，内存最好不低于8G）。

咨询及报名方式

报名方式：

1.联系销售。

2. 电话登记报名。

电话：021-61539657（工作日9:30-18:00）；联系人：年雨慧

3.发送邮件至邮箱nianyh@rainbow-genome.com，邮件标题注明：“培训班报名”。邮件内容注明：姓名＋手机号＋单位＋学历；

 

怎样付款？

1. 公司银行汇款：

户　名：上海嘉因生物科技有限公司

开户行：中国建设银行上海彰武路支行

账　号：31001543600050007330

请核对账户名及账号，并在汇款用途处注明姓名和单位（重要）

2. 支付宝转账

账户：18721077175 郭永靖

3. 现场现金

可开发票。

 

怎样享受课程优惠？

1.3月31日之前报名交费优惠300元；

2.转发本条微信到朋友圈，点赞人数超过16人并截图发送至嘉因生物微信公众号后台（记得附上您的姓名和联系方式哦~），即可享受优惠150元；

3.即日起至2017年4月6日，签订项目并支付项目款5万元以上者，赠送免费名额一个。

以上优惠可以叠加使用！

 

关于嘉因生物的介绍
上海嘉因生物科技有限公司，由生物信息学家、生物统计学家和生物学家共同创办的新型生物技术公司。核心成员来自哈佛大学、加州大学洛杉矶分校、同济大学、中山大学等国内外知名学府。是致力于高通量实验设计、高通量实验实施以及生物信息学分析的医学科研服务企业。我们专注于表观遗传学研究、转化医学研究、癌症基础研究、癌症分类研究、遗传病研究等领域的稳健高通量实验实施、表观实验实施和定制化高通量数据分析服务。团队核心成员已在国际顶尖学术期刊Nature, Cancer Cell等杂志发表近20篇学术论文。

联系电话：021-61539657，上海嘉因生物科技有限公司

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