“蛋白表达”疑难解惑第十弹:藻类表达支持
Q1
你们是否有数据能够证明克隆到藻类载体后的蛋白表达水平?
Q2
如何检测藻类细胞的生长?
可通过OD750检测细胞生长,线性范围将在0.2-1.2(在1 cm光路中)之间。如果所得OD值过高,请稀释并再次检测。完全生长通常需要5-6天。可利用赛默飞的Countess细胞计数仪或Tali 细胞计数仪进行精确检测。计算细胞数量的公式如下:
Q3
使用衣藻基因工程试剂盒进行整合的原理是什么?
整合是随机的。基因工程试剂盒是基于随机插入,这会导致目的基因快速丢失。蛋白表达试剂盒含有pChlamy_4载体,经过设计可表达出带有博来霉素/Zeocin抗性基因sh-ble的转录融合蛋白(Rasala et al., 2012)。口蹄疫病毒(FMDV)2A肽段的自切割序列位于抗生素抗性基因和目的基因之间。该序列可编码一个约20个氨基酸的短序列,介导发生适当切割并产生2个独立蛋白。
我们使用该系统得到的阳性转化株,即使在有或无筛选压力下传代多次之后,依然能够维持高表达水平,其持续时间远远长于其他系统。
Q4
预期的转化效率是多少?
我们未报导衣藻细胞的转化效率,因为转化的最终结果是随机整合到基因组。电穿孔结果取决于目的基因。每个电穿孔反应中,对照载体应产生最少30个转录株。在每个挑选出的菌落中,目的基因阳性克隆数应不少于90%。
Q5
核转化与叶绿体转化有何区别?
Q6
沉默程度取决于基因序列和从该基因表达到细胞中的蛋白的毒性。pChlamy_4载体专为避免发生常出现于C. reinhardtii的转基因沉默而设计。同时,该载体经过设计,可表达出带有博来霉素/Zeocin抗性基因(sh-ble)的转录融合蛋白。口蹄疫病毒(FMDV)2A肽段的自切序列位于抗生素抗性基因和目的基因之间。该序列可编码一个约20个氨基酸的短序列,介导发生适当切割并产生2个独立蛋白。
我们使用该系统得到的阳性转化株,即使在有或无筛选压力下传代多次之后,依然能够维持高表达水平,其持续时间远远长于其他系统。
Q7
使用pSyn_1载体时,目的基因的基础表达很低。你们有何建议?
pSyn_1的启动子是Psc。Psc是一种弱组成型启动子,可启动目的基因的基础表达。而pSyn_6的启动子是psbA启动子(PpsbA)。PpsbA是细长聚球藻psbA基因(编码光合系统II蛋白D1)的一种强组成型启动子,可启动目的基因的高水平表达。
Q8
我正在使用藻类MAXEfficiency 转化试剂转化衣藻。但是,转化效率非常低。如何能够对此进行改善?
请查看以下建议:
1.为得到最佳结果,藻类细胞浓度应在1 x 106至2 x 106细胞/mL之间(OD范围为0.3-0.5)。细胞浓度不可超过3 x 106细胞/mL。可通过OD750检测细胞生长,线性范围将在0.2-1.2(在1 cm光路中)之间。如果OD值超出线性范围,请稀释并再次检测以获得准确读数。
公式为:细胞数= (OD750 – 0.088)/ 9 × 106 /mL
2.线性DNA转化比环状DNA转化的效率高很多(有效率约高出70%)。
3. DNA的质量和浓度对于转化效率至关重要。您将需要使用PureLink®HQ、PureLink® HiPure或相同质量的质粒纯化试剂盒进行DNA纯化。使用小体积的浓缩纯化DNA要比使用大体积的低浓度DNA更好。(如果您在转化线性质粒,则在线性化之后,您将需要在转化前使用凝胶提取或PCR净化试剂盒对质粒进行纯化处理。)我们建议每次电穿孔使用2 µg的线性质粒DNA。
4.质粒DNA是随机插入到基因组的。通常,只有20%的转化株会明显表达目的基因。我们建议首先通过菌落PCR对菌落进行筛选,确保启动子和目的基因的完全整合,随后通过筛选多个阳性克隆,挑选出表达水平最高的克隆。
5.由于C. reinhardtii基因组具有非常高的GC含量(约62% GC),如果目的基因适应了高表达C. reinhardtii基因的密码子使用偏好,则重组基因的表达水平会明显改善。
6.由于转化效率取决于构建体向基因组的随机整合,电穿孔结果将取决于目的基因的性质。您可尝试转化试剂盒中的对照载体,从而确认试剂盒及其电穿孔方法是有效的。
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