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接种后适应期太长
1）种子活性太低
策略：调大种子的OD值，是种子处于对数生长期初期
2）接种量太小
策略：适当加大接种量（根据经验值）
3）菌种老化
策略：更换感受态细胞重新转导（初次发酵），降低种子OD值（非初次发酵）
4）染菌
策略：根据染菌程度做处理
接种后，生长一段时间后停止生长，过一段时间又生长
1）自诱导
策略：优化培养基：改变培养基组成或者调整各组分的比例（一般调整氮源，一般调整酵母粉的比例，自诱导主要是酵母粉里的乳糖引起）
接种后，生长一段时间后停止生长且OD值开始下降(自溶）
1）感染噬菌体
策略：确定噬菌体感染的原因。种子浸染，需重新克隆菌种；培养基感染可换另外的菌种试验；发酵罐空气进罐过滤器感染，需更换过滤器且对发酵罐及管理进行化学消毒除了。另外浸染噬菌体需要停止发酵，并对发酵环境，物料等做全面的清洁灭菌处理。
2）补料C,N比不合适
策略：由于补料C,N比不合适引起的自溶过程比较缓冲，优化补料配方。
3）菌种老化及保存不当
策略：生长缓慢，且自溶的过程比较缓慢，此时需要重新克隆菌种。
4）染菌
策略：报废处理，且严格无菌操作。
发酵过程中pH迅速下降且溶氧下降
1）C源的消耗乳酸的生成
策略：补碱，调转速和通气量及罐压
发酵过程中pH迅速上升且溶氧上升
1）C源不足，并消耗乳酸
策略：补C源
调升pH时菌的生长变慢
1）pH调节剂浓度太高或者调节过程太快
策略：降低调节剂的浓度，降低调节剂的流加速度
补料后pH还在上升且溶氧上升
1）补料速度太慢
策略：加快补料速度或调高补料浓度
补料后pH下降太快溶氧不变
1）补料速度太快
策略：降低补料速度或调低补料浓度
补料后菌的增殖变慢
1）产生葡萄糖效应
策略：降低补料速度或调低补料浓度，同时也可更换C源
诱导后不表达
1）诱导时间不合适
策略：调整诱导时间（一般是诱导的过早，菌还处于对数生长期前期，致使诱导后菌的生长速度太大，繁殖过程中质粒丢失）
2）诱导剂浓度不合适
策略：调整诱导剂浓度
3)诱导条件不对
策略：优化诱导温度，诱导时间
4）质粒丢失
策略：重新克隆，并用选择性培养基筛选稳定克隆
5）克隆基因序列不合适
策略：优化克隆基因序列，优化启动子，密码子（在定点突变时常发生）
诱导后表达量太低
1）诱导的太晚
策略：调整诱导时间（一般使诱导时菌处于对数生长期末期）
2）诱导条件不合适
优化优点条件，如温度，诱导剂浓度等
诱导时间点的确定
1）跟俊OD值确定菌的生长状态
策略：根据OD值的变化确定菌的生理状态，使诱导时间点菌处于对数生长期末期
发酵过程发生异常
应根据pH，DO,OD等变化综合分析！
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