目前主流的定量蛋白质组学方法有5种，分别iTRAQ、SILAC、MRM(MRMHR)、label-free和SWATH 。其中最流行的是iTRAQ定量蛋白质组方法，该方法不依赖样本，可以做任意样本的总蛋白质的差异定量，而且定量准确，这个层次上label-free虽然也可以做任意样本，但是定量准确度难以保障。SILAC是仅仅适合细胞层次的蛋白质组定量，组织的定量需要摸索或者前人已经摸索的模式，中途测试新组织难度较大，极易失败，细胞层次的SILAC培养费用高昂，不适合做商业化。MRM和SWATH都是目标蛋白质组相关的定量模式，但是SWATH可以完成数千种蛋白的定量，准确度极高，通量远高于MRM，对于亚细胞结构、细菌、真菌、细胞分泌物等样本，SWATH效果非常好。
SWATH分析流程
● 对样品进行蛋白提取和纯化
● 使用Trypsin等蛋白酶将蛋白酶切成多肽片段
● 利用LC-MS色谱质谱串联分析技术，对多肽片段进行分离和SWATH质谱分析
● 使用OpenMS/Skyline等软件对质谱数据进行分析
● 经过生物信息学分析鉴定差异性蛋白并阐述差异性蛋白的生物学功能
SWATH技术平台
我们拥有当下主流的高分辨质谱AB SCIEX TripleTOF5600plus，完全满足SWATH对仪器扫描速度和检测精度的要求
SWATH技术特点
● 定量鉴定复杂的样品中所有分子，包括低表达蛋白和低丰度的被修饰蛋白
● 定量准确度高：定量准确度与MRM技术相当
● 通量大：一次实验可定量检测到2000种以上蛋白
● 完整全面信息存储，存储所有检测分子的MS，MS/MS每个峰值的数据，无需重复检测同一样品
● 无需像MRM技术对样品测定方法进行调试
除了SWATH我们还可以提供多种蛋白组学技术服务
项目名称 | 项目类型 | 项目周期 |
蛋白鉴定 | 胶内/溶液内蛋白鉴定 | 10个工作日 |
Label-free | 非标定量 | 25个工作日 |
iTRAQ、双甲基化 | 标记定量 | 30个工作日 |
磷酸化 | 磷酸化蛋白鉴定/定量 | 10-30个工作日 |
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