蛋白质组学入门第三期

2023-05-10 14:56:27

我们在之前的软文中给大家介绍了蛋白组学定性研究的一个整体实验流程图。我们可以看到蛋白质酶解以后经过除盐或者说是液相的分离以后,一般就要进入质谱仪进行检测分析了,那么质谱仪究竟是个什么玩意,太复杂的那些原理咱们就不说了。简单地说,它就像个黑箱子,我们把酶解好的肽段输入到这个黑箱子中,它通过一系列手段记录下这些肽段的特征并将其分离,从而通过计算机系统的采集将这些肽段的信息转化成谱图的形式。

接下来的工作就是对这些谱图进行解析,将其转化为我们的蛋白组学结果。要知道一个组学实验采集到的谱图有上百万甚至百万张,对这么多的谱图进行解析就好比我们警察拿着犯罪嫌疑人的照片去茫茫人海中抓人,因此,工作量是很大的,还在现在有强大的搜库软件帮助我们,我们将这个蛋白质进行名称解析的过程称之为搜库。通过将实际得到的图谱与我们理论上的进行匹配,简单点说就是综合匹配度最高的就被认定为我们鉴定到的蛋白。这样就知道我们样本中检测到的蛋白质有哪些。如果需要对这些蛋白质进行定量的研究,这里小编给大家推荐几个技术(Label Free, iTRAQ/TMT, DIA/SWATH),不了解的同学可以去百度一下。

 

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