蛋白质组学最值得关注的技术——蛋白DIA定量技术介绍

2023-05-10 14:56:27

在蛋白质组学研究领域,基于液相色谱-质谱联用(LC-MS/MS)技术的发现蛋白质组学可在生物样本中检测和相对定量上千个蛋白,在过去十几二十年中已得到广泛的应用,并且发展出了标记定量(iTRAQ/TMT、SILAC)和非标记定量(label free)两种主流方法,这些方法都是基于数据依赖采集模式(data-dependent acquisition, DDA)来采集蛋白质谱数据的,该方法也称为“鸟枪法(shotgun)。


然而,DDA数据采集模式具有重复性差、定量不精准、数据缺失多、低丰度蛋白难以检测等固有缺点。


基于MRM/SRM/PRM的靶标蛋白质组学,可以为几十到上百个目标蛋白提供精确的绝对定量结果,并且重复性很高,是质谱绝对定量的金标准。但通量相对较低,无法开展高通量蛋白的精确定量。


那么,有没有一种方法技术,即高通量又定量精准重复性高呢?近几年发展起来并迅速火起来的DIA技术(data-independent acquisition,数据非依赖采集)就是这么一种技术。


该技术融合了传统蛋白质组shotgun的高通量和质谱绝对定量金标准MRM/PRM的定量精确的优点,被Nature Methods杂志评为2015年最值得关注的技术。近三年DIA的发表文章数目增长迅速,是目前蛋白质组学研究领域的香饽饽。


蛋白DIA定量发文趋势(数据来源Pubmed)

 

本期51期)的omicshare在线课堂,我们将为您详细介绍蛋白DIA定量技术的技术原理、方法优势、实验流程与分析内容,以及该技术在不同领域的应用,让您全面了解这一蛋白定量新技术,开拓您的科研思路,助力您的科学研究。

课堂内容


1. 蛋白DIA技术原理介绍

通过详细介绍DDA和DIA两种数据采集模式的原理,说明DIA技术的独特优势;

2. 蛋白DIA实验流程与分析内容

介绍蛋白DIA定量的实验流程,以及分析内容;

3. 蛋白DIA应用

通过高分文献介绍蛋白DIA定量在不同研究领域的应用方向。


下面是部分课件截图:





 第51期 OmicShare 在线课堂将于5月10(下周四)16:00准时开始,大家可以在基迪奥微信公众号底端菜单栏的“在线课堂”报名(点“阅读原文”也可以)~

Tips:

对蛋白组感兴趣的老师和同学可留言咨询,基迪奥生物有丰富的项目经验,提供专业的解决方案和一对一的个性化分析服务!

今天的内容就到这里啦~


友情链接

Copyright © 2023 All Rights Reserved 版权所有 福建水产设备联盟