目前, 市面上销售的胶原蛋白产品多数是由陆源哺乳动物体内提取出来的。但近年来随着疯牛病、口蹄疫等人畜共患疾病的流行及宗教信仰的原因, 人们急于寻找一种新的富含胶原蛋白的原料来替代从陆源哺乳动物中提取的胶原蛋白。研究发现,鱼体废弃物中鱼皮、鱼骨、鱼鳞等部位含有大量的胶原蛋白。我国每年处理的鱼体废弃物总量高达200万吨。
水产动物的皮、骨、鳞、肌肉等部位富含大量的胶原蛋白,目前,已分离出来的鱼胶原主要是分布在真皮、骨、鳞、鳔、肌肉等部位, 分析鱼鳞的成分可以得知, 鱼鳞富含的胶原蛋白占鱼鳞总蛋白的10％～40％且鱼鳞脂质含量少, 相比于目前生产的胶原蛋白的主要原料猪皮和牛皮而言, 更有利于胶原蛋白的提取和分离。
鱼肉中的胶原蛋白含量相比于其他部位较少, 仅占蛋白质总量的 3%。陆源哺乳动物胶原已分离和发现了 27 种不同的类型,对于鱼胶原来讲, 只分离出少数几种胶原蛋白类型, 主要有 I 型和 V 型胶原,Ⅰ型胶原蛋白是水产品加工废弃物含量最多的蛋白质, 占胶原蛋白含量的90%左右，国内水产胶原的开发和利用现在仍处于起步阶段, 更多的是借鉴陆源哺乳动物提取胶原蛋白的方法。目前,鱼胶原蛋白的提取方法主要有5类, 即酸提法、碱提法、酶解提法、中性盐提法以及热水提取法。胶原提取必须在较低的温度下进行, 否则,3条肽链完全解离且蛋白质高温易失去活性, 温度一般控制在0℃～10℃之间。盐提法和酸提法是指未能共价交联或者在体内未成熟的胶原利用中性盐或稀乙酸溶液溶解而将胶原从生物体内提取出来的方法; 酶提法是指三螺旋网状纤维等难溶性胶原, 通过生物酶如胃蛋白酶或者其它常用消化酶去除末端的非螺旋形区域, 再以稀乙酸提取的方法, 提取出来的胶原粗制品经反复透析、离心等纯化处理后, 经冷冻干燥可制得纯的胶原蛋白制品。
观察鱼类胶原蛋白一级结构可以得出,水产胶原蛋白19种氨基酸单元相互连接而成,甘氨酸残基的数量约占整体氨基酸残基的1/3, 即每隔两个其它氨基酸残基即有一个甘氨酸，遵循(Gly-X-Y)n的原则,其中 X, Y 代表除甘氨酸之外的任何一种氨基酸,(Gly-Pro-Hyp)n 这个序列在胶原域中较为常见, 且胶原蛋白中含有其它蛋白质所没有的脯氨酸、羟脯氨酸, 因此其常作为胶原蛋白的特征氨基酸。
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