今天是第652期日报。
Science[IF:37.205]
① 对家族性腺瘤性息肉病（FAP）患者的结肠黏膜进行活组织检查，发现存在pks+大肠杆菌和肠毒性脆弱拟杆菌（ETBF）组成的细菌生物被膜，及两种菌产生的促肿瘤毒素的共表达；② 在小鼠模型中，相较于定殖单一菌株，pks+大肠杆菌和ETBF共同定殖可显著增加肿瘤数量和死亡率；③ ETBF可降解粘液层，增加粘附于结肠粘膜的pks+大肠杆菌，后者释放colibactin导致结肠上皮细胞发生DNA损伤；④ 两种菌共定殖可诱导结肠IL-17显著上升，加剧结肠肿瘤恶化。
Patients with familial adenomatous polyposis harbor colonic biofilms containing tumorigenic bacteria
2018-02-02 DOI: 10.1126/science.aah3648
Gut[IF:16.658]
① 选取接受过根除幽门螺杆菌（Hp）治疗的瑞典人群，根据年龄、性别和年份，计算标准化的胃腺癌和非贲门胃腺癌（NCGA）的发病率（SIR）；② 2005至2012年，随访接受根除Hp治疗的95176人，分别有75人（0.1%）和69人（0.1%）发生胃腺癌和NCGA；③ 根除治疗后，胃腺癌的风险随时间下降，1-3年SIR为8.65，3-5年SIR为2.02，5-7.5年SIR为0.31，NCGA则分别为10.74、2.67和0.43；④ 胃癌发病率低，是否值得广泛开展根除性治疗需要更多研究。
Helicobacter pylori eradication treatment and the risk of gastric adenocarcinoma in a Western population
2018-01-30 DOI: 10.1136/gutjnl-2017-315363
Gut[IF:16.658]
① 前瞻性检测1265例II/III期结直肠癌（CRC）患者的TIL/MMR状态和BRAF/KRAS突变，确定142例CRC的共同分子亚型；② 根据TIL和MMR状态，CRC分为四个亚型，61.3%为TIL低/MMR正常（pMMR），14.8%为TIL高/pMMR，8.6%为TIL低/MRR缺陷（dMMR），15.2%为TIL高/ dMMR；③ 经602例CRC验证，TIL高/dMMR者预后最佳，TIL低/dMMR和TIL低/pMMR的DFS差，TIL高/pMMR患者的预后居中；④ 与NCCN高风险特征、基因组学和转录组学亚型相比，TIL/MMR的预后意义更大。
Lymphocytic response to tumour and deficient DNA mismatch repair identify subtypes of stage II/III colorectal cancer associated with patient outcomes
2018-01-30 DOI: 10.1136/gutjnl-2017-315664
Microbiome[IF:8.496]
① 短多重区域框架（SMURF）是一种将来自不同PCR扩增区域的测序结果组合分析的方法，可鉴定接近全长的16S rRNA基因序列，与现有技术相比分辨率更高；② 该方法只需适度的记忆即可极快重建，简单且低成本，实现了低生物量和片段化DNA的高分辨率分析；③ 通过计算机模拟分析，SMURF可分别将人类微生物组计划和人类肠道细菌分离株的模拟混合物分辨率提高了2倍和100倍；④ SMURF可应用于任何一组扩增子，从而实现有效的下游分析。
Combining 16S rRNA gene variable regions enables high-resolution microbial community profiling
2018-01-26 DOI: 10.1186/s40168-017-0396-x
Analytical Chemistry[IF:6.320]
① 数据量和复杂的等级关系是研究肠道菌群与脑代谢组学之间关系的主要障碍，利用两级策略对大鼠生长过程中的肠道菌群-肠-脑轴关系进行分析；② 分析表明，脑代谢组和肠道菌群与年龄相关，且在整体变化模式上相似；③ 通过单变量和多变量相关分析筛选出4个高分类水平的相关“代谢物类型 - 细菌门”对， 包括：脂质-螺旋体门、游离脂肪酸-厚壁菌门、胆汁酸-厚壁菌门、神经递质-拟杆菌门；④ 关键相关配对还需由独立的动物实验验证。
A strategy for association study on intestinal microbiome and brain metabolome across lifespan of rats
2018-01-21 DOI: 10.1021/acs.analchem.7b02859
Science
① 据达沃斯世界经济论坛的最新报告，在大型医药公司中，葛兰素史克（GSK）和强生在对抗细菌耐药性上排名前两位；② 迈兰、西普拉和费森尤斯卡比公司在仿制药公司中排名较高，美国的Entasis Therapeutics公司是排位最高的生物技术公司；③ GSK及强生的高排名来源于为贫困人群提供抗生素、医师教育、较高的研发投入；④ 新指标还包括处理含抗生素污水的政策、耐药性数据分享等；⑤ 新指标也有缺陷，导致所获数据未必真实反映对抗细菌耐药性的投入。
This new index ranks companies’ efforts in the fight against antimicrobial resistance
Science
① 细菌在感染部位形成生物膜，是重要的耐药机制；② 人体内的免疫调节蛋白LL-37具有天然杀菌活性，经过剪切和修饰后形成衍生蛋白SAAP-148，通过破坏细菌细胞膜达到广谱杀菌效果；③ SAAP-148可根除人皮肤表面和老鼠背部伤口的生物膜中的金黄色葡萄球菌和鲍曼不动杆菌，以及经利福平处理的生物膜中的持留菌，反复使用未引发金黄色葡萄球菌的耐药性；④ SAAP-148不会粘附血脂和血蛋白，其杀菌活性不被抑制；⑤ SAAP-148有望用于治疗局部感染。
A powerful new weapon against drug-resistant bacteria was inspired by the human body
Neurotherapeutics[IF:5.166]
① 脊髓损伤（SCI）破坏自主神经系统，减弱其协调全身器官功能的能力；② SCI导致神经系统对胃肠道的调控受损，影响了胃肠道的运动、粘膜分泌、免疫监视、肠道上皮屏障通透性，引起细菌易位及肠道菌群失调；③ SCI引起肠道生态失调可加剧椎管炎症和损伤病变，导致运动功能恢复受损，而口服益生菌可缓和或恢复这些影响；④ 肠道优势菌群可成为SCI的药物靶点，可开发个性化的营养制品（益生菌/元）治疗上述合并症并改善SCI后的健康和生活质量。
Gut Microbiota Are Disease-Modifying Factors After Traumatic Spinal Cord Injury
2017-11-03 DOI: 10.1007/s13311-017-0583-2
感谢本期日报的创作者：mildbreeze，花开，小扣啊，潇洒小姐，小肠君，女巫
点击阅读过去10天的日报：
0130 | 菌群vs心血管：克利夫兰大佬和中国门徒连发3篇
点击阅读原文，查看更多热心肠日报的内容
Copyright © 2023 All Rights Reserved 版权所有 福建水产设备联盟