Anal. Chem.| 蛋白质组学检测糖蛋白质组的合成及降解

2023-05-10 14:56:27

今天与大家分享一篇发表在Analytical Chemistry上的文章“Simultaneous quantitation of glycoprotein degradation and synthesis rates by integrating isotope labelling, chemical enrichment and multiplexed proteomics”。文章的通讯作者是乔治亚理工学院的Ronghu Wu教授,他们课题组主要通过蛋白质组学技术研究蛋白翻译后修饰以及细胞代谢。


蛋白糖基化在细胞功能中有着重要作用。糖基化修饰不仅调控蛋白活性而且可能通过空间位阻而保护糖蛋白免于蛋白酶降解。很多重要蛋白都可以被糖基化修饰,而它们的动态平衡将对细胞功能产生重要影响。本文作者通过集合pulse-SILAC结合化学富集技术,可以同时监控糖蛋白的降解及合成。具体来说就是先构建重标SILAC细胞系,在细胞基本长满后,切换到轻标培养基继续培养,然后通过基于硼酸的化学富集方法、多重标记(TMT)以及生物质谱技术进行蛋白质组学分析。这样,通过不同时间点的比较,就可以通过重标肽段的减少得知糖蛋白降解速率,而通过轻标肽段的增加得知糖蛋白合成速率。



本文巧妙的结合了pulse-SILAC以及多重标记的化学蛋白质组学技术,在组学层面实现糖蛋白组的合成及降解同时检测的效果。编者按,如果可以进一步引入糖修饰速率的检测可能更有利于阐述糖基化修饰对于蛋白质稳态的作用。


原文链接: 

http://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.analchem.7b02241

原文引用:

DOI: 10.1021/acs.analchem.7b02241 (2017).


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