A Esteban）、张必良和鲍习琛领衔的科研团队开发 RICK 技术首次分离 RNA 结合蛋白。该技术是全面分析细胞内的 RNA—蛋白相互作用的重要工具，有助于揭开基因组中的“暗物质”——非编码 RNA 的未知功能。相关研究 2 月 13 日在线 发表 于《自然—方法学》。
有数以百计的蛋白质可以与 RNA 结合，其中很多涉及神经退行性病变、自身免疫缺陷和癌症等疾病。那么，如何系统地分离 RNA 结合蛋白的问题变得引人注目。前期科学家系统地分离了细胞内 mRNA 结合蛋白，这只是众多转录本中的一部分，细胞还包含了很多非 polyA RNA。
研究人员设计了 RICK 技术，利用核酸标记技术，巧妙地将新合成的 RNA 标记上生物素，通过链霉亲和素偶联的磁珠，分离得到相应被标记 RNA 分子和与其相结合的蛋白分子。通过这一技术，研究人员系统地分离了包括非 polyA 尾 RNA 和新生 RNA 在内的一系列 RNA 分子及其结合蛋白。
进一步分析发现，细胞分裂调控因子作为新的 RNA 结合蛋白，存在结合非 polyA 尾 RNA 的潜能。研究人员缩短标记的时间，成功地在细胞中分离了新生 RNA 结合蛋白。这些蛋白与新生 RNA 的转录及后续的加工、剪切等调控密切相关。这一技术的应用将有助于深入地剖析 RNA 结合蛋白的作用机制，也是细胞命运转变过程中分析 RNA 蛋白相互作用的重要工具。
原文检索：
Capturing the interactome of newly transcribed RNA
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