蛋白质是细胞的分子机器,由DNA储存密码制造,发生在DNA或蛋白质水平上的变化很可能导致疾病,分子层次的改变被认为是心脏病的根本原因,所以准确地知道蛋白质的种类、分布和功能对心脏研究十分重要。
近日,德国心脏中心和Max Planck生化研究所(MPIB)的研究人员在《Nature Communications》发表文章,编绘了第一张健康人类心脏地图,亦被称为心脏蛋白质组学(cardiac proteome)。
MPIB心血管外科副主任Markus Krane教授和团队共采集了超150份心脏组织样本,使用精细的细胞培养方法,从中提取不同的细胞类型进行蛋白质谱分析。他们以精准、可重复、快速的标准改进了分析方法,在短短2天内就鉴定出近11000种蛋白质,比传统技术快了两倍!
研究人员确定了心脏所有区域的蛋白质信息,如心脏瓣膜、心脏腔和主要血管。此外,他们还研究了三种不同类型心脏细胞的蛋白质组成:心脏成纤维细胞、平滑肌细胞和内皮细胞。通过质谱分析,他们总共发现了近11000种不同蛋白。
“从这张人类心脏蛋白质图谱中,我们发现所有健康心脏都以非常相似的方式工作,”Sophia Doll说。“我们测量了所有心脏组织的蛋白质组分,但它们差别不大。此外,我们还惊讶地发现,尽管左右心脏功能截然不同:右半部分输送缺氧血液,左半部分输送富氧血液,但它们的蛋白质构成却极为相似。”
心脏蛋白质图谱 来源:MPIB
为了测试健康心脏数据是否可以指导疾病检测,研究人员还比较了心房颤动患者心脏蛋白质组。结果找到了该疾病病因的初步线索:患病的心脏组织中负责向细胞提供能量的蛋白质与正常心脏不同。
另一个有趣的发现是:尽管所有患者的能量代谢相关蛋白都发生了改变,但个体间变化有所不同。这些发现提示我们,个性化医疗的重要程度。“尽管所有患者都有相似症状,但数据告诉我们,每个病例都存在不同的分子功能障碍,我们需要学习如何认识和对待心脏药物的个体差异,”德国心脏中心心血管外科副主任Markus Krane博士说。
研究人员表示,蛋白质图谱具体信息将可以在MaxQB 数据库获取。
MaxQB 数据库
原文检索:
S. Doll, M. Dreßen, P. E. Geyer, D. Itzhak, C. Braun, S. Doppler, F. Meier, M.-A. Deutsch, H. Lahm, R. Lange, M. Krane, M. Mann, Region and cell-type resolved quantitative proteomic map of the human heart, Nature Communications, November 2017, DOI: 10.1038/s41467-017-01747-2
文章转自:生物探索、生物通
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