差异蛋白质组学研究发现了NAFLD的致病蛋白

2023-05-10 14:56:27

英文题目:Comparative proteomic study reveals 17β-HSD13 as a pathogenic protein in nonalcoholic fatty liver disease

中文题目:差异蛋白质组学研究发现17β-HSD13是非酒精性脂肪肝的致病蛋白

期刊名:PNAS     IF:9.674      发表时间: 2014

样品类型:人肝脏脂肪小滴、胶条

研究背景:

NAFLD是一种慢性肝细胞疾病,在发达国家影响了超过25%的人群,这种疾病最终会发展成肝脏纤维化和肝硬化。本文报道了人类肝脏LD蛋白质组以及比较了NAFLD和非NAFLD蛋白表达差异,并且发现17β-HSD13NAFLD疾病进展的致病蛋白。这一结果把LD蛋白和肝脂肪变性致病因建立了联系。

研究思路:

临床样本建立LD相关蛋白组全谱→NAFLD和非NAFLD蛋白表达差异→发现重要差异蛋白17β-HSD13→目标蛋白的功能分析和验证(动物模型);内容参考下图。

重要结果: 

1通过对三个正常人的样本分析,共鉴定到713LD相关蛋白质(见图3-1A和图B的交集),其中人类肝脏LD相关蛋白质有148个(见图B的交集部分),归类成10个蛋白group,后者中17.6%已有文献报道。

 LD相关蛋白组草图建立

A图为3个正常样本的LD相关蛋白的SDS-PAGE分析,B图为质谱鉴定到的三个样本的蛋白数量韦恩图,C图为LD相关蛋白基于已有文献或NCBI数据库的亚细胞分布和功能。

2)通过比较NAFLD和非NAFLD样本蛋白表达差异,检测到差异蛋白89个,其中上调蛋白54个,下调蛋白35个。17β-HSD13为重要上调蛋白。

3LD相关差异蛋白

 LD相关差异蛋白分析

(+NAFLDNAFLD样本的SDS-PAGE图,。切胶后2D-LC-MS/MS蛋白鉴定,得到NALFD差异蛋白。-)NAFLD为正常人群的SDS-PAGE图,蛋白上样量相同,其中红色箭头指示的条带为SDS-PAGE图中LD相关上调蛋白(条带1-7),绿色箭头指示的条带为SDS-PAGE图中LD相关下调蛋白(条带8-12)。

进一步分析这些差异蛋白的KEGG通路和network,发现17β-HSD13为关键上调蛋白,并经过进一步的WB(图B)、免疫染色等方法验证(图 C)。最后作者在db/m db/db mice两种小鼠模型上进行验证,确证17β-HSD13在高脂饮食小鼠中表达水平显著高于正常小鼠。

17β-HSD13在NAFLD和正常样本中的表达差异

研究结论:

148LD相关蛋白,其中89个差异表达蛋白,PATFAS家族和酶参与维甲酸代谢,这些蛋白在NAFLD病人肝脏中表达上调。17β-HSD13被鉴定到是LD相关蛋白中在NAFLD致病机制中发挥重要作用。

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