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导 读
腺苷（A）与肌苷（I）RNA编辑在癌症转录组中可实现许多核苷酸的改变。 然而，由于转录后调控的复杂性，RNA编辑对人类癌症中蛋白质组多样性的贡献仍不清楚。 在这里，研究人员对TCGA基因组数据和CPTAC蛋白质组学数据进行了综合分析。
尽管存在有限的位点多样性，科研人员证明A到I RNA编辑通过改变氨基酸序列有助于增大乳腺癌中的蛋白质组多样性。 我其验证了RNA和蛋白质水平的编辑的可实用性。 编辑的COPA蛋白在体外增加癌细胞的增殖，迁移和侵入。 该研究表明A-to-I RNA编辑对癌症蛋白质多样性的重要贡献，并突出其翻译潜力。
腺苷（A）到肌苷（I）RNA编辑是人类中最普遍的RNA编辑机制，其中ADAR酶在选择性转录物的特定核苷酸位点处将A转变为I而不影响DNA序列同一性。尽管广阔大多数A到I编辑发生在非编码区域，但有趣的是已经报道了几种单独RNA编辑在肿瘤发生中发挥关键作用，例如肝癌中的AZIN1编辑，胶质母细胞瘤中的CDC14B编辑，RHOQ编辑在结肠直肠癌，SLC22A3和IGFBP7在食管癌中的编辑，胃癌中的PODXL编辑和乳腺癌中的GABRA3编辑。
RNA编辑与蛋白表达
使用来自癌症基因组图谱（TCGA）的RNA测序（RNA-seq）数据，最近的研究已经在癌症转录组中检测到大量的A至I编辑的实现，其中许多有临床相关性。然而，人类癌症RNA编辑模式的研究到目前为止仅集中在RNA水平上。鉴于转录后调控的巨大复杂性，研究人员旨在解决由错义A到I编辑所产生的遗传信息被翻译成蛋白质序列的程度，从而有助于癌症蛋白质组学的多样性。最近从临床蛋白质组肿瘤分析联盟（CPTAC）获得的质谱（MS）数据提供了解决这个问题的机会，因为它们是从患者样品产生的具有来自TCGA的平行基因组和转录组数据的队列。
了解促成癌细胞蛋白质多样性的机制是癌症研究中的一个基本问题，因为突变蛋白已被广泛用作生物标志物和治疗靶点，并且最近的研究将其作为癌症免疫疗法的主要决定因素。这项研究提供了大规模的直接证据，表明在癌症中A到I RNA编辑的技术可明显提高蛋白质多样性的表达水平。
虽然从蛋白质水平检测到的DNA突变和通过RNA编辑的突变位点绝对数量较低，但研究人员的分析提供了对这两种机制对癌症蛋白质多样性的较为详细的阐述。在所调查的三种癌症类型中，RNA编辑对癌症蛋白质组多样性的贡献在BRCA中最显着。即使就变异肽的独特变体而言，RNA编辑的贡献也是值得注意的。事实上，根据特定位点的平均覆盖率，改变蛋白质序列的RNA编辑位点的实际数量可能是该研究中确定的10-100倍。然而，RNA编辑的水平因细胞而异，通常低于体细胞突变。
已明确的A到I编辑可实现的变应肽
在以前的研究中报道的COG3和COPA可以功能性地驱动癌细胞的生长和迁移，类似于驱动体细胞突变。总的来说，该研究表明，A至I RNA编辑至少在某些癌症类型中有助于蛋白质异质性，因此值得癌症研究界去阐明人类癌症的分子基础并开发预后和治疗方法。相信在不久的未来，利用RNA编辑技术与PD-L1联合抗癌会取得不错的治疗效果。
参考文献
Xinxin Peng, Xiaoyan Xu,Yumeng Wang. A-to-I RNA Editing Contributes to Proteomic Diversity in Cancer
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