植物RNA提取
植物组织成分相对于动物组织来说复杂多样,因此其RNA的分离和纯化的难度也随之加大,如果要完美的数据结果,那么提取纯度高、完整性好的RNA就成了关键所在。
植物RNA的提取一般会经历以下几个过程:
1、破碎细胞壁
2、裂解细胞膜
3、杂质去除,包括:DNA、蛋白质、多糖、多酚、次生代谢产物等
4、纯化和浓缩RNA
而在RNA提取过程中,纯化除杂的过程是影响RNA纯度的关键所在。在完整的细胞内,多糖多酚类化合物,次级代谢产物,蛋白质如RNase等与核酸是分离的,一旦细胞破碎,这些物质就不可避免的会与RNA发生相互作用。
那下面我们就一起来看看RNA纯化过程中,经常出现的4类问题以及相应的应对策略吧~
问
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1、植物组织采集过程中应尽可能采集幼嫩组织,对组织进行冷冻保存,并在短时间内提取RNA;对于采集回的样品如要长期保存,应经液氮处理后储存在-80℃冰箱,且在样品与裂解液接触前,应防止冷冻的样品解冻,否则酚易被氧化成醌。
2、为防止多酚氧化,在裂解样品的同时可以加入适量的抗氧化剂。
问
答
问
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1、裂解液中加入蛋白质变性剂,如异硫氰酸胍,2-巯基乙醇,SDS等可去除大部分蛋白质。
2、可以利用蛋白酶K降解蛋白质,最后再用苯酚/氯仿除去残留的蛋白质或是直接利用TRK-1002试剂盒对RNA进行后续的纯化工作。
次生代谢产物是指某些生物利用某些初生代谢产物为原料,在一系列酶的催化下,形成一些特殊的化学物质,这些化学物质即为次生代谢产物,这是一类非生长所必需的小分子有机化合物,但对于植物自身在复杂环境中的生存和发展起着不可替代的作用,如生物碱、黄酮类、萜类、有机酸、木质素等。
问
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看完这些,大家也赶紧回去看看自己的提取有没有什么问题吧~
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