生物滤池是工厂化循环水养殖中最关键的部分，也是最困难和需要维护的部分。 在养殖水体中，氨氮来自于养殖鱼类鳃部的直接排泄，其次是鱼类的粪便、残饵以及其他含 氮有机物的分解。氨氮(分子态氨)对鱼类的毒性很大，亚硝酸盐及硫化氢一旦在水中含 量过高会导致鱼类的死忙，是水产养殖和水族馆养殖中需要克服的首要问题。
规划生物滤池时，设计者应该首要考虑生物滤池的设计净水能力要能够保证养殖系统中TAN浓度不超过设定上限。了解TAN浓度非常重要，因为生物滤池的氨氮移除速率是和滤池内氨氮浓度息息相关：生物滤池的移除速率与TAN浓度成正比。同时，养殖系统的最大投喂率对规划生物滤池也很关键：系统内投喂率和饲料中蛋白含量会影响氨氮生产速率。
确定需要的VTR值是整个设计中最困难的一个步骤。
1.在养殖池中确定TAN的最大允许浓度。
2.估计系统的最大投喂率并计算TAN的最大生成速率
3.由之前的试验或者生产者的说明确定生物滤池中填料的VTR。
4.计算预测的生物滤池中填料的用量需求。
计算生物滤池硝化能力的最佳方式是用“克/立方米/天“为单位来测量生物滤池中填料的单位体积TAN转化率（ VTR）。设计者了解当前VTR的测定条件并且将这些条件和系统在生物承载高峰时的条件相比较是非常有关键的。生物滤池中TAN含量越低，VTR也随之降低。而在大多数情况下，VTR是在特定的生物滤池，填料在特定的参数下计算出来的，是由生物滤池填料的类型和系统调节共同决定。
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