一、具有抗肿瘤作用
食用菌中的真菌多糖可对肿瘤的抑制率达80—90%以上的有100余种。其中香菇多糖、灵芝多糖、姬松茸多糖、猪芩多糖均在临床上得以应用、疗效显著。
二、增强人体免疫功能
食用菌多糖具有活性成分，有活化人体细胞免疫，促进淋巴细胞的转化，并能激活T细胞与β细胞，如：香菇、姬松茸、灰树花。食用菌还能提高巨噬细胞的吞噬功能。促进淋巴细胞的转化。如：云芝、灵芝、猴头菇。它还能提高巨噬细胞的吞噬功能。如：猴头菇、黑木耳、茯苓多糖。
三、增强体液免疫功能
增强人体体液免疫作用。补体是一组极为复杂的血清蛋白（人体共有补体 9种成分）。如香菇、云芝能促补体活性作用。
四、能抗病毒作用（流感等）
菌中可分离出剌激机体产生干扰素的物质，该物质经分折为双链RNA，它能剌激机体产生干扰素，抑制病毒的增殖，为抗流感病毒新的药性物质。
五、预防和治疗心血管系统疾病
食（药）用菌具有调节心脏功能，改善心脏血液流动，增加冠状动脉血流量，降低心肌耗氧量，改善心肌缺血等功能。降血脂作用，在食用菌中的银耳、黑木耳、毛木耳、猴头、香菇、冬虫夏草都有明显的降血脂作用。银耳多糖可明显降低高血脂症、甘油三脂、β—脂蛋白的含量。香菇有降血脂的功能，是因为在香菇中的香菇嘌呤里含有一种降脂很强的腺嘌呤衍生物。长根菇的发酵物中分离出长根素有降血脂作用。有降血压作用还有灵芝、蘑菇、草菇、金针菇、银耳、黑木耳、毛木耳、松菇、长柄侧耳等。
六、保肝解毒作用
灵芝与香菇能降低四氯化碳、硫代乙酰胺、强的松等药物对肝损伤，并引起的GPT的升高，同时还可提高四氯化碳肝损伤所引起的肝糖含量，说明灵芝、香菇有保肝作用。云芝水提物对治疗乙肝有效，亮菌对胆囊炎，急、慢性肝炎有较好疗效。茯苓有渗湿利尿、健脾安神之功能，在临床上常用于治疗急性肝炎。
七、具有健胃养胃作用
猴头菇可利五脏，助消化，其药理表明对治疗消化不良、消化道恶性肿瘤、胃及十二指肠溃疡有较好疗效。平菇有益气杀虫作用，对肝炎、胃溃疡、十二指肠溃疡、慢性胃炎、尿道结石、胆结石有防治作用。金针菇子实体中富含精氨酸，能预防和治疗肝脏、胃溃疡等疾病。
八、对中枢神经系统的镇定作用
灵芝浓缩液有镇静作用，蜜环菌、灵芝、安络小皮伞、冬虫夏草有明显镇静作用，可治疗神经衰弱与失眠。天麻与蜜环菌对中枢神经系统有镇静作用，对头晕、肢麻、失眠等症有效，具镇痛作用的有安络小皮伞、灵芝、竹黄等。有改善镇痛、抗炎、消肿作用，可治疗风湿性关节炎、坐骨神经痛、跌打损伤、腰肌劳损、筋骨酸痛等。
九、降低血糖与抗放射作用
不少食用菌可降低血糖值。银耳孢子多糖对糖尿病有明显预防作用。冬虫夏草有促进细胞分泌胰岛素使血糖值降低。灵芝多糖B和灵芝多糖C有明显降血糖作用和抗放射作用。双孢蘑菇中含有多量酪氨酸酶，是一种降血压剂，可治高血压，并能溶解一定量的胆固醇；长根菇发酵液中含有小奥德蘑酮，有强烈的降血压作用；香菇含有的酪氨酸氧化酶可降血压。灵芝和木耳亦都具有降压作用。
十、清除自由基抗衰老作用
自由基是细胞代谢过程中产生的有害物质，它能诱导氧化反应，使生物膜中多种不饱和脂类发生超氧化变性，形成脂质过氧化物，引起细胞结构和功能的改变，导致器官组织的损伤，灵芝热水提取物、灵芝多糖均具有清除自由基活性，如清除氧自由基和羟自由基（—OH）的作用。
十一、延年益寿的作用
黑木耳多糖、银耳多糖能明显延长果蝇的平均寿命，具延缓衰老作用。
食用菌中的黑木耳多糖与银耳多糖对果蝇脂质有明显降低作用，并使小鼠心肌脂质含量明显下降，起延长寿命的作用。
十二、预防爱滋病作用
目前法国方面已注意到利用灰树花多糖的RBM功能，使T细胞有重建恢复机体的自我调节能力，。已引起医药界密切注意。目前正深入研究。又椐最新报道，服用灵芝与姬松茸也具有提高爱滋病病人的免疫功能。
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