iNature:人工智能(Artificial lnterligence,AI),它是研究,开发用于模拟,延伸和扩展人的智能的理论,方法,技术及应用系统的一门新兴技术科学。从人工智能这个概念的提出到数据加模型方法的盛行,再到基于GPU算神经网络的深度学习,人工智能可谓是三起三落,同时它也标志着人工智能在一步步的走向成熟,飞入寻常百姓家,就在我们身边,触手可及:阿尔法狗大战柯洁可谓是酣畅淋漓,谷歌和百度的无人驾驶,日本的HRP-4C机器人。如今人工智能系统被越来越的运用到各个领域,近日Nature,Science,Cell和Nature Biot齐发文,剑指风云激荡的人工智能领域。iNature编辑部特将这几篇文章汇总于此,以飨读者。
2018年3月14日,Nature上在线报道了来自百余家实验室近150多位科学家的研究论文“DNA methylation-based classification of central nervous system tumours”的研究论文,研究人员开发了一种AI系统,是基于肿瘤组织DNA的甲基化数据来准确的区分近100种不同的中枢神经系统肿瘤。在诸多癌症中,中枢神经系统肿瘤可以说是最难搞的。目前科学家已经确定的中枢神经系统肿瘤足有100来种,它们的临床表现和生物学特性有高度特异性,很难确诊。由于此类肿瘤的分子标志物稀少,目前临床上中枢神经系统肿瘤的诊断核心技术还是基于显微镜的组织学诊断。所以这项研究对于癌症的精确治疗,确实是一个巨大的飞跃。但是,研究人员同时也表示,基于甲基化数据的AI系统目前也并不是很完善,不能作为单一的诊断标准,还需要临床的验证。不过作为研究的工具,它也确实将使中枢神经系统肿瘤科研前进一大步。
原文链接:
http://www.nature.com/nature/journal/v555/n7697/full/nature26000.html
2017年12月8日,Dileep George等人在Science上在线发表了题为“A generative vision model that trains with high data efficiency and breaks text-based CAPTCHAs”的研究论文,该研究通过从系统神经科学中汲取灵感,引入了递归皮层网络(RCN),一种基于消息传递的推理以统一方式处理识别,分割和推理的视觉概率生成模型。RCN学习的培训数据非常少,通过生成分割字符从根本上打破了现代基于文本的CAPTCHA的防御。此外,RCN在各种基准测试中胜过深度神经网络,而且数据效率更高。研究结果表明,纳入来自神经科学的归纳偏见的结构化概率模型可以导致强大的,可推广的机器学习模型,以高数据效率进行学习。此外,研究的模型在打破基于文本的CAPTCHA方面的有效性,只需很少的培训数据,这表明网站应该寻求更强大的机制来检测自动交互。
原文链接:
http://science.sciencemag.org/content/358/6368/eaag2612.long
2018年2月23日,广州市妇女儿童医疗中心基因检测中心主任、加州大学圣地亚哥分校Shiley眼科研究所教授张康(本文的通讯作者)研究团队,在Cell以封面文章发表了题为“Identifying Medical Diagnoses and Treatable Diseases by Image-Based Deep Learning ”的研究论文,这不仅是中国研究团队首次在顶级生物医学杂志发表有关医学人工智能的研究成果,也是世界范围内首次使用如此庞大的标注好的高质量数据进行迁移学习,并取得高度精确的诊断结果,实现用AI精确推荐治疗手段的突破。
原文链接:
http://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(18)30154-5
2018年1月29日,Sungrop Yoon等人在NatureBiotechnology上在线发表了题为“Deep learning improvesprediction of CRISPR–Cpf1 guide RNA activity”的研究论文,该研究提出了两种算法来预测AsCpf1介导RNA的活性。在基于卷积神经网络的深度学习框架中使用15,000个目标序列的Indel频率来训练Seq-deepCpf1。然后,研究人员引入染色质可访问性信息,为可获得此类信息的细胞系创建性能更好的DeepCpf1算法,并显示这两种算法在先前的研究中和已发布的数据集上均优于以前的机器学习算法。
原文链接:
https://www.nature.com/articles/nbt.4061
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