上海所揭示表观调控蛋白MLL5参与抗病毒免疫功能及机制

2023-05-10 14:56:27

 


3月 28日,国际学术期刊Nature suppresses antiviral innate immune response by facilitating STUB1-mediated RIG-I degradation”。该研究揭示了表观遗传调控蛋白Mixed Lineage Leukemia 5 (MLL5)在抗病毒天然免疫过程中的新的调控机制。研究发现MLL5介导病毒RNA受体RIG-I与其E3泛素连接酶STUB1的结合,促进STUB1对RIG-I蛋白K48位泛素化修饰与蛋白降解,进而调控宿主抗病毒天然免疫过程。

 

 

RIG-I蛋白是细胞质中主要的病毒RNA受体,可以识别细胞内RNA病毒的感染并激活下游抗病毒的天然免疫反应。RIG-I蛋白的水平受到严格的调控,以维持体内处于合适的免疫稳态,防止过强的免疫反应损伤自身。Trithorax蛋白家族是一类在进化中非常保守的表观遗传调控蛋白,参与细胞核内组蛋白H3K4的甲基化修饰与基因的转录调控。MLL5是Trithorax蛋白家族的重要成员,在造血干细胞“自我更新”、精子发生、细胞周期调控等过程中发挥了重要的作用,但其在抗病毒天然免疫过程的作用之前未有研究。

 

(a)野生型和mll5基因敲除小鼠对VSV-GFP感染后体重变化曲线和存活率曲线。(b)野生型和mll5基因敲除小鼠病毒感染后肺部组织HE染色。(c)MLL5调控RLR通路模式图。

 

在本项研究中,博士研究生周培培在其硕士阶段的工作基础上(THE JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY,2013:288:17532-17543),进一步发现了MLL5在RIG-I介导的抗病毒天然免疫过程中的负性调控作用。RNA病毒Vesicular stomatitis virus (VSV)感染MLL5基因敲除的HEK293T细胞后,细胞产生的I-干扰素与炎症因子的水平明显增加,同时VSV的复制能力显著降低。与此同时,DNA病毒Herpes simplex virus (HSV-1)感染在MLL5基因敲除的细胞,其I-干扰素与炎症因子的产生水平没有变化,显示MLL5特异性地参与了RNA病毒诱导的免疫反应的调控。相应地,与野生型对照小鼠相比,Mll5基因敲除小鼠对VSV病毒的感染更为耐受,能够产生更多的IFN-β、TNFα和IL6细胞因子。进一步的研究发现,MLL5基因缺失后,尽管DDX58基因(编码RIG-I蛋白)的转录没有增加,但RIG-I蛋白显著增加,并且K48泛素化修饰水平降低,显示RIG-I蛋白的降解受到抑制。蛋白定位研究发现,尽管大多数MLL5蛋白分布在细胞核中,一小部分MLL5蛋白定位在细胞质中。免疫共沉淀与蛋白质谱研究发现,胞浆中的MLL5能够介导RIG-I以及E3泛素化酶STUB1结合。STUB1是RIG-I蛋白特异性的E3泛素化酶,可以催化RIG-I蛋白第K48位的泛素化修饰,促进RIG-I蛋白的降解。当MLL5蛋白缺失后, RIG-I与STUB1的结合减弱,RIG-I蛋白的降解受抑制,进而导致RIG-I在细胞中的积累。相应地,当在细胞中过表达MLL5蛋白时,RIG-I与STUB1的结合显著增强,促进RIG-I蛋白的K48位泛素化修饰和溶酶体途径的降解。有趣的是,在VSV感染后,细胞核内的MLL5蛋白会想胞浆中转移,促进对RIG-I蛋白的降解。该研究揭示了表观遗传调控因子MLL5蛋白,通过一种不同于经典的表观遗传调控的作用机制,参与机体抗病毒天然免疫的调节,并且为天然免疫的调控提供给了新的靶点。

  

该研究是在张岩教授的指导下,。、肖晖研究员、钟劲研究员,,上海交通大学免疫学研究所李斌教授,国立新加坡大学邓力文教授的大力支持。该项目获得了国家自然科学基金委员会、。 


张岩课题组主要研究方向:


(1)造血免疫细胞发生、发育与癌变的表观遗传调控  

造血免疫系统中的细胞均由骨髓中的造血干细胞分化发育而来。造血干细胞的“自我更新”与定向分化受到细胞内转录因子、表观遗传调控因子、信号通路以及骨髓微环境的严格调控。 我们实验室利用多种基因敲除小鼠模型,研究组蛋白修饰酶、染色质重塑蛋白等表观遗传调控因子在造血干细胞发生发育、“自我更新”功能维持、定向分化过程中,以及在造血系统疾病(如白血病)发生中的功能与作用机制。 

  

(2)大片段染色体定点遗传操作技术的研发 

利用大段染色体(Mb级)遗传操作可以实现染色体的定点缺失、移位、倒置,在肿瘤细胞模型与动物模型的构建中,具有重要的应用。我们实验室结合同源重组技术、基因编辑技术与重组酶介导片段互换技术,发展跨物种Mb级染色体片段定点遗传操作技术,并利用该技术可以构建携带大段人源染色体的转基因小鼠模型。该模型在发育生物学研究、癌症研究以及全人抗体研发中有重要的应用。 

  

(3)人源化小鼠模型的研发 

人类细胞或组织可以通过移植在免疫缺陷的小鼠体内存活并生长,是肿瘤研究、药物研发重要的工具模型。我们实验室通过转基因与基因敲入的技术,将若干人细胞因子基因导入小鼠基因组,对免疫缺陷小鼠的体内微环境进行进一步改造,使得人类造血免疫细胞能够在小鼠体内更好地发育分化。 


Abstract

Trithorax group protein MLL5 is an important epigenetic modifier that controls cell cycle progression, chromatin architecture maintenance, and hematopoiesis. However, whether MLL5 has a role in innate antiviral immunity is largely unknown. Here we show that MLL5 suppresses the RIG-I-mediated anti-viral immune response. Mll5-deficient mice infected with vesicular stomatitis virus show enhanced anti-viral innate immunity, reduced morbidity, and viral load. Mechanistically, a fraction of MLL5 located in the cytoplasm interacts with both RIG-I and its E3 ubiquitin ligase STUB1, which promotes K48-linked polyubiquitination and proteasomal degradation of RIG-I. MLL5 deficiency attenuates the RIG-I and STUB1 association, reducing K48-linked polyubiquitination and accumulation of RIG-I protein in cells. Upon virus infection, nuclear MLL5 protein translocates from the nucleus to the cytoplasm inducing STUB1-mediated degradation of RIG-I. Our study uncovers a previously unrecognized role for MLL5 in antiviral innate immune responses and suggests a new target for controlling viral infection.

来源:

本期编辑:Tony




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