人类SRMAtlas是靶向识别及可重复性定量预测人类蛋白质组中所有蛋白的一些高度特异性质谱测定法的一个汇编目录,包括针对许多剪接变异体、非同义突变和翻译后修饰的检测方法。
美国系统生物学研究所(ISB)的资深研究员Ulrike Kusebauch博士在7月28日的《细胞》(Cell)杂志上发表研究报告,描述了与ISB、苏黎世联邦理工学院及其他一些研究机构的科学家们合作开发出人类SRMAtlas的成果。
人类SRMAtlas是靶向识别及可重复性定量预测人类蛋白质组中所有蛋白的一些高度特异性质谱测定法的一个汇编目录,包括针对许多剪接变异体、非同义突变和翻译后修饰的检测方法。研究人员采用称作为选择性反应监测的技术,利用166,174个已充分确定特征的化学合成水解肽段(roteotypic peptides)开发出了这些检测方法。
这一SRMAtlas资源在http://www.srmatlas.org免费公开提供,将让一些重点、假设驱动及大型蛋白质组规模的研究获益。由于在理论上现在可以鉴别和定量任何样本中所有的蛋白质,研究人员预计这一资源将会大大推动基于蛋白质的实验生物学来了解疾病转变和健康轨迹。
能够可靠、可重复性地检测任何组织或细胞类型中人类蛋白质组的所有蛋白,对于了解系统层次的特性和生理及疾病中一些特异的信号通路具有革命性意义。在美国系统生物学研究所Robert Moritz的实验室中,借助称作为选择性反应监测(SRM)的方法,一个合作项目生成并验证了一些高度特异性靶向蛋白质组检测法的一个汇编目录,通过这一可广泛获取的、敏感及强大的靶向质谱方法SRM,现在能够量化20,277个注释人类蛋白质中99.7%的蛋白。这一人类SRMAtlas为确凿地鉴别生物样本中单独的肽段提供了明确的检测坐标。
重大突破:击败最诱人的癌蛋白
人类癌症的“蛋白组-基因组学”特征
首张人体蛋白详细图谱公布 基因组与蛋白质对对碰
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