【精彩内容】一场蛋白质组学与中医药的碰撞!

开发了国际上首个中药分子作用机制的生物信息学在线分析工具BATMAN-TCM （2016 Sci Rep），并成功应用于多个中药的机制研究中（Evid Based Complement Alternat Med. 2012；BMCComplement Altern Med. 2014)，该工具已为同行提供数据分析服务累计近5000次；发展了一种新颖的药物的治疗、药理和化学属性的预测方法SPACE，该方法效果超过以往所有方法(Bioinformatics, 2015)；发展了蛋白质相互作用网络数据预测和质量控制方法PRINCESS和SLIPPER (Mol Cell Proteomics, 2008,2013);合作开发了组学数据分析和可视化平台CAPER (JPR 2013, 2014). 几年来，在相关领域发表第一作者（含并列第一作者）论文9篇，累计影响因子43.6。获得4项软件著作权。2012年获中国电子学会电子信息科学技术奖一等奖（排名第10）。作为负责人负责一项国家自然科学基金（青年），一项北京市科技新星项目，并作为骨干参与国家国际合作专项、973,、863等多个课题。

开发了国际首个一站式蛋白质组数据分析云系统Firmiana（梧桐树），方便了无生物信息学基础的科研人员使用。

Firmiana支持包括来自Thermo，ABSciex，Agilent等不同厂商的质谱原始数据格式，整合了多种现有的蛋白质组学分析工具(ProteoWizard，Mascot，X!Tandem，InterProphet等等)，开发了多种定量和质量控制算法，并提供了多种生物信息学分析（聚类分析，差异蛋白分析，通路富集分析等）以及数据挖掘功能。Firmiana平台所提供的数十种在线的生物信息学工具有很好的兼容性、持续可开发性和易用性，无生物信息学基础的科研人员也可以无障碍的使用。截止到2017年10月，Firmiana已存储并处理了来自十一个物种的超过7000份实验数据。

发表文章：

Feng, J., Ding, C., Qiu, N., Ni, X., Zhan, D., Liu, W., ... & Nie, P.(2017). Firmiana: towards a one-stop proteomic cloud platform for dataprocessing and analysis. Nature biotechnology, 35(5), 409.

Zhou, Q., Liu, M., Xia, X., Gong, T., Feng, J., Liu, W., ... & Qin, J.(2017). A mouse tissue transcription factor atlas. Nature Communicati, 8.

2010年进入北京蛋白质组研究中心，拥有丰度的质谱相关使用经验，擅长非标定量蛋白质组学技术，翻译后修饰蛋白质组学技术，以及质谱数据的生物信息学分析等。

发表文章

Cai, L., Tu, J., Song, L., Gao, Z., Li, K., Wang, Y., ... & Ding, C.(2017). Proteome-wide mapping of endogenous SUMOylation sites in mouse testis.Molecular & Cellular Proteomics, 16(5), 717-727.

Yu, P., Song, L., Qin, J., & Wang, J. (2017). Capturing the photo‒signaling state of aphotoreceptor in a steady‒state fashion by binding a transition metal complex.Protein Science.

Shi, W., Li, K., Song, L., Liu, M., Wang, Y., Liu, W., ... & He, F.(2016). Transcription Factor Respe Elements on Tip: A Sensitive Approach forLarge-Scale Endogenous Transcription Factor Quantitative Identification.Analytical Chemistry, 88(24), 11990-11994.

Lin, H. P., Cheng, Z. L., He, R. Y., Song, L., Tian, M. X., Zhou, L. S.,... & Shi, Y. H. (2016). Destabilization of fatty acid synthase byacetylation inhibits de novo lipogenesis and tumor cell growth. Cancerresearch.

从事中药心脑血管药理方向研究工作，运用蛋白质组学，结合转录组及生物信息学，成功地构建了一套多组学整合研究策略，并将该策略用于中药复方制剂如丹红注射液和益心舒胶囊治疗心血管疾病的分子作用机制与关键作用靶点的研究上。先后在Free radical biology and medicine(IF=5.6) 和ScientificReports（IF=4.25）上发表论文。近五年内发表SCI论文8篇，其中第一作者论文7篇。作为项目负责人，承担国家自然科学青年基金项目一项。